1回の出撃で遊ぶステージを「ミッション」と呼び、
このミッションが6個集まったものを「ダンジョン」と呼びます。
最初はダンジョン1のミッション1のみが解放されており、
ミッションをクリアする毎に、新たなミッションが解放されていきます。
ひとつのダンジョンに含まれるミッションを全て攻略し、
攻略バッジ（後述）を規定数集めれば、新たなダンジョンが解放されます。
エピソード1には、3つのダンジョンが3難易度ぶん用意されており、
最大54ミッションまで遊ぶことができますが、
他のエピソードを購入すれば、新たなダンジョンが追加されます。
（ダンジョン以外にも、キャラクター/敵/武器など様々なものが追加されます。）